Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLD3Q8IV08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLD3Q8IV08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms