Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LDLRAD3Q86YD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms