Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM3Q86VH5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM3Q86VH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM3Q86VH5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms