Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms