Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CMC1Q7Z7K0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC1Q7Z7K0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms