Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTF1AQ7RTS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTF1AQ7RTS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTF1AQ7RTS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms