Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Vma21Q78T54 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vma21Q78T54 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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