Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms