Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNE3Q6ZMZ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms