Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms