Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms