Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASC4Q6P4E1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms