Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USPL1Q5W0Q7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USPL1Q5W0Q7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms