Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GARNL3Q5VVW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GARNL3Q5VVW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms