Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms