Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms