Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms