Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CT47A1Q5JQC4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms