Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A13Q5J8X5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms