Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P5Q59GN2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL39P5Q59GN2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms