Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GREB1Q4ZG55 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GREB1Q4ZG55 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms