Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS9Q3SYG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms