Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRNQ16849 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRNQ16849 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms