Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFTN1Q14699 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms