Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DDX39BQ13838 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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