Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEUROD1Q13562 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEUROD1Q13562 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEUROD1Q13562 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms