Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB3BPQ13352 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB3BPQ13352 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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