Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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