Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGDRQ13258 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGDRQ13258 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGDRQ13258 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
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