Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNIP1Q12981 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms