Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX4Q12846 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX4Q12846 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX4Q12846 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STX4Q12846 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
STX4Q12846 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
STX4Q12846 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms