Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BPTFQ12830 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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