Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 MDN1YLR106C 14733 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 SLM2YNL047C 1971 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 AAD3YCR107W 1092 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MGT1YDL200C 567 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 HAT2YEL056W 1206 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YGL082WYGL082W 1146 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YAL004WYAL004W 648 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 REE1YJL217W 597 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RPL17AYKL180W 555 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 POF1YCL047C 777 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TDA3YHR009C 1572 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TGL3YMR313C 1929 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MIF2YKL089W 1650 nt3.36□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 POL31YJR006W 1464 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MSD1YPL104W 1977 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 TGL1YKL140W 1647 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RXT3YDL076C 885 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MIC26YGR235C 702 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ARC15YIL062C 465 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MCK1YNL307C 1128 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 ECM8YBR076W 1065 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 DER1YBR201W 636 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 DOA4YDR069C 2781 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YMR1YJR110W 2067 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 RDS1YCR106W 2499 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 MGA1YGR249W 1371 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 OAF3YKR064W 2592 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 YMR317WYMR317W 3423 nt3.35□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 AIM39YOL053W 1188 nt3.34□□□□□ -1.87
MSH5Q12175 PFK26YIL107C 2484 nt3.34□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 SAF1YBR280C 1914 nt3.34□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YVC1YOR087W 2028 nt3.34□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YHL012WYHL012W 1482 nt3.34□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RRN6YBL014C 2685 nt3.34□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ARO80YDR421W 2853 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 GSC2YGR032W 5688 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 DAP2YHR028C 2457 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PRM15YMR278W 1869 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RTN1YDR233C 888 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YNK1YKL067W 462 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MTR2YKL186C 555 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ULP1YPL020C 1866 nt3.33□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 KIN2YLR096W 3444 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 GCN1YGL195W 8019 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YDL228CYDL228C 642 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RPC11YDR045C 333 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 DET1YDR051C 1005 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 OKP1YGR179C 1221 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PET54YGR222W 882 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YUH1YJR099W 711 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MFA2YNL145W 117 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RPC34YNR003C 954 nt3.32□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PMS1YNL082W 2622 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 SSE2YBR169C 2082 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PPQ1YPL179W 1650 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ARO1YDR127W 4767 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YGR117CYGR117C 1431 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 KRE28YDR532C 1158 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 BCD1YHR040W 1101 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 SFH5YJL145W 885 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ECM15YBL001C 315 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MOH1YBL049W 417 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 SIL1YOL031C 1266 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 OAZ1YPL052W 879 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 OPY1YBR129C 987 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RIB5YBR256C 717 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ISM1YPL040C 3009 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 STU2YLR045C 2667 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 VPS33YLR396C 2076 nt3.31□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YDL180WYDL180W 1644 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ARG5,6YER069W 2592 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 NEM1YHR004C 1341 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 AIM7YDR063W 450 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 RPA14YDR156W 414 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 ERJ5YFR041C 888 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 BET1YIL004C 429 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PHD1YKL043W 1101 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MRPL3YMR024W 1173 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YBL065WYBL065W 345 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 TIR2YOR010C 756 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 AIM41YOR215C 558 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MCM16YPR046W 546 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 LCB5YLR260W 2064 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 CWH43YCR017C 2862 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YPS7YDR349C 1791 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MAL12YGR292W 1755 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 MAL32YBR299W 1755 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 FAR1YJL157C 2493 nt3.3□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 VTC4YJL012C 2166 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 CPA2YJR109C 3357 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 TMA108YIL137C 2841 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 PSF1YDR013W 627 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 DIB1YPR082C 432 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YBR137WYBR137W 540 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 POL2YNL262W 6669 nt3.29□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 CUE3YGL110C 1875 nt3.28□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 SSU1YPL092W 1377 nt3.28□□□□□ -1.88
MSH5Q12175 YCR007CYCR007C 720 nt3.28□□□□□ -1.88
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