Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 SDT1YGL224C 843 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YJL028WYJL028W 336 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YLL047WYLL047W 384 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 MCK1YNL307C 1128 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 MED7YOL135C 669 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 SPS4YOR313C 1017 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YPL077CYPL077C 723 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YMR1YJR110W 2067 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 VPS45YGL095C 1734 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 MCP2YLR253W 1710 nt3.56□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 SHQ1YIL104C 1524 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 RAD1YPL022W 3303 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 TRX3YCR083W 384 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 HSP42YDR171W 1128 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 ATP5YDR298C 639 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 BMH1YER177W 804 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 SCL1YGL011C 759 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 MOH1YBL049W 417 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 AIM14YGL160W 1713 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 AKR1YDR264C 2295 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 LCB5YLR260W 2064 nt3.55□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 TAF8YML114C 1533 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 GEM1YAL048C 1989 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 NHX1YDR456W 1902 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 RSC1YGR056W 2787 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 HMS1YOR032C 1305 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 OPI6YDL096C 327 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 AGE2YIL044C 897 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 RSM25YIL093C 795 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 PSF3YOL146W 585 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 BAG7YOR134W 1230 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 MNR2YKL064W 2910 nt3.54□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YDL026WYDL026W 312 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 ADH4YGL256W 1149 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 BET1YIL004C 429 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 ARC15YIL062C 465 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 TFA2YKR062W 987 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 ECM4YKR076W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 RUF21RUF21 707 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 RPL18AYOL120C 561 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 TDA3YHR009C 1572 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 ECM16YMR128W 3804 nt3.53□□□□□ -1.84
YPQ1Q12010 GCD1YOR260W 1737 nt3.53□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 DIP2YLR129W 2832 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 MSS2YDL107W 1056 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YDR222WYDR222W 1248 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YIL089WYIL089W 618 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 AUR1YKL004W 1206 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YPT7YML001W 627 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 IST1YNL265C 897 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YBR137WYBR137W 540 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 AME1YBR211C 975 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 PRP3YDR473C 1410 nt3.52□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 PCL2YDL127W 927 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 RPC11YDR045C 333 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 ERV29YGR284C 933 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YUH1YJR099W 711 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 UTP23YOR004W 765 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 TMC1YOR052C 453 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 SLM5YCR024C 1479 nt3.51□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 VPS27YNR006W 1869 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 TCO89YPL180W 2400 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YNR063WYNR063W 1824 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YCR007CYCR007C 720 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 OKP1YGR179C 1221 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 REE1YJL217W 597 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 HRT3YLR097C 1035 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YNR071CYNR071C 1029 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 TMA16YOR252W 537 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 MRPL51YPR100W 423 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 BMT2YBR141C 1014 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 NOC2YOR206W 2133 nt3.5□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 PRS5YOL061W 1491 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 GAL11YOL051W 3246 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 MLH2YLR035C 2088 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 snR63snR63 255 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YDR336WYDR336W 945 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YGR219WYGR219W 342 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 BIO2YGR286C 1128 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 PSY3YLR376C 729 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 SPO20YMR017W 1194 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YOR186WYOR186W 435 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 SSP2YOR242C 1116 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 BUD27YFL023W 2391 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 PEP7YDR323C 1548 nt3.49□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 FAD1YDL045C 921 nt3.48□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 RPS11AYDR025W 471 nt3.48□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.48□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 AHP1YLR109W 531 nt3.48□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 APL4YPR029C 2499 nt3.48□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 VMA1YDL185W 3216 nt3.47□□□□□ -1.85
YPQ1Q12010 MSR1YHR091C 1932 nt3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms