Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIPPLY1Q0D2K3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms