Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms