Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE4DQ08499 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms