Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDR1Q08345 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDR1Q08345 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDR1Q08345 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms