Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP1Q07960 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP1Q07960 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP1Q07960 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP1Q07960 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP1Q07960 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms