Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms