Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51Q06609 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms