Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDSRQ06136 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDSRQ06136 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms