Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
IRF8Q02556 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms