Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN2Q02246 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms