Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAP1Q01518 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAP1Q01518 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAP1Q01518 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAP1Q01518 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms