Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HSF1Q00613 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HSF1Q00613 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms