Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HDLBPQ00341 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms