Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
RPS29P62273 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RPS29P62273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RPS29P62273 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
RPS29P62273 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RPS29P62273 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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