Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXW4P57775 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms