Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRG3P56975 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRG3P56975 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRG3P56975 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRG3P56975 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG3P56975 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRG3P56975 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG3P56975 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG3P56975 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG3P56975 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms